Imunopatogenesis dan Virologi Covid19

wp-1579581166372.jpgImunopatogenesis dan Virologi Covid19

Widodo Judarwanto, Sandiaz Yudhasmara

Penyakit Covid19 adalah sejenis pneumonia virus dengan wabah yang tidak biasa di Wuhan, Cina, pada bulan Desember 2019, yang disebabkan oleh sindrom pernafasan akut yang parah Covid19. Munculnya SARS-CoV-2 telah ditandai sebagai pengenalan ketiga coronavirus yang sangat patogen ke dalam populasi manusia setelah coronavirus sindrom pernafasan akut yang parah Covid19 dan coronavirus sindrom pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV) di abad kedua puluh satu.

Novel pneumonia-induced pneumonia, yang dinamai sebagai penyakit Covid19 oleh WHO pada 11 Februari 2020, telah meningkat pesat dalam skala epidemi sejak pertama kali muncul di Wuhan, Cina, pada Desember 2019. Pada hari yang sama, komisi klasifikasi virus internasional mengumumkan bahwa coronavirus baru dinamai sebagai sindrom pernafasan akut yang parah Covid19. Covid19 bukanlah wabah penyakit pernapasan parah pertama yang disebabkan oleh coronavirus. Hanya dalam dua dekade terakhir, coronavirus telah menyebabkan tiga penyakit epidemi, yaitu, COVID-19, sindrom pernafasan akut yang parah (SARS) dan sindrom pernapasan Timur Tengah (MERS). Saat ini, kasus COVID-19 telah ditemukan di banyak negara di seluruh dunia. Menurut data terakhir, hingga 1 Maret 2020, jumlah kasus yang dikonfirmasi di China mencapai 79.968, di mana 2.873 orang meninggal, dan 41.681 disembuhkan. Selain China, jumlah kasus yang dikonfirmasi di negara lain juga mencapai 7.041, di mana 105 orang meninggal, dan 459 disembuhkan. Pada tanggal 31 Januari 2020, Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) mengumumkan bahwa COVID-19 terdaftar sebagai Emergency Public Health Emergency of International Concern (PHEIC), yang berarti bahwa ia dapat menimbulkan risiko bagi banyak negara dan memerlukan respons internasional yang terkoordinasi. Tinjauan ini mencoba menjelaskan patogenesis imun molekuler dan diagnosis COVID-19 dan memberikan referensi untuk pencegahan dan pengembangan obat infeksi Covid19, berdasarkan kemajuan penelitian terbaru Covid19 dan pengetahuan dari para peneliti pada Covid19 dan MERS-CoV.

Virologi Covid19

Coronaviruses adalah virus yang diselimuti dengan perasaan positif genom RNA beruntai tunggal (26-32 kb). Empat gen coronavirus (α, β, γ, δ) telah diidentifikasi sejauh ini, dengan human coronavirus (HCoVs) terdeteksi dalam α coronavirus (HCoV-229E dan NL63) dan β coronavirus (MERS-CoV, SARS-CoV, HCoV- Genera OC43 dan HCoV-HKU1). Pada akhir Desember 2019, pasien yang mengalami batuk, demam, dan dispnea dengan sindrom gangguan pernapasan akut (ARDS) karena infeksi mikroba yang tidak dikenal dilaporkan di Wuhan, Cina. Sekuensing genom virus dari lima pasien dengan pneumonia yang dirawat di rumah sakit dari 18 Desember hingga 29 Desember 2019, mengungkapkan adanya strain β-CoV yang sebelumnya tidak diketahui pada mereka semua. Novel β-CoV yang terisolasi ini menunjukkan 88% identitas pada urutan dua sindrom pernapasan akut parah (SARS) yang diturunkan seperti kelelawar, kelelawar-SL-CoVZC45 dan kelelawar-SL-CoVZXC21, dan sekitar 50% identitas pada urutan MERS-CoV. Novel β-CoV kemudian dinamai “SARS-CoV-2” oleh Komisi Klasifikasi Virus Internasional. Pohon filogenetik dari genona lengkap seperti SARS seperti sekuens genom jelas digambarkan pada Gambar. 1A.

Patogenesis COVID-19

  • Pasien dengan COVID-19 menunjukkan manifestasi klinis termasuk demam, batuk tidak produktif, dyspnea, mialgia, kelelahan, jumlah leukosit normal atau menurun, dan bukti radiografi pneumonia, yang mirip dengan gejala infeksi Covid19 dan MERS-CoV Oleh karena itu, walaupun patogenesis COVID-19 kurang dipahami, mekanisme serupa dari Covid19 dan MERS-CoV masih dapat memberi kita banyak informasi tentang patogenesis infeksi SARS-CoV-2 untuk memfasilitasi pengenalan kita terhadap Covid19.

Entri dan replikasi Coronavirus

  • Protein Coronavirus S telah dilaporkan sebagai penentu yang signifikan dari masuknya virus ke dalam sel inang. Glikoprotein lonjakan amplop berikatan dengan reseptor selulernya, ACE2 untuk SARS-CoV dan SARS-CoV-2, CD209L (lektin tipe-C, juga disebut L-SIGN) untuk SARS-CoV, DPP4 untuk MERS-CoV. Masuknya SARS-CoV ke dalam sel awalnya diidentifikasi untuk dilakukan dengan fusi membran langsung antara virus dan membran plasma. Belouzard dkk menemukan bahwa peristiwa pembelahan proteolitik kritis terjadi pada protein Covid19 S pada posisi (S2 ′) memediasi fusi membran dan infektivitas virus. MERS-CoV juga telah mengembangkan aktivasi furin dua langkah yang abnormal untuk fusi membran. Selain fusi membran, endositosis yang bergantung pada clathrin dan dependen juga dimediasi oleh entri SARS-CoV. Setelah virus memasuki sel, genom RNA virus dilepaskan ke dalam sitoplasma dan diterjemahkan menjadi dua poliprotein dan protein struktural, setelah itu genom virus mulai mereplikasi. Glikoprotein amplop yang baru dibentuk dimasukkan ke dalam membran retikulum endoplasma atau Golgi, dan nukleokapsid dibentuk oleh kombinasi RNA genom dan protein nukleokapsid. Kemudian, partikel virus berkecambah ke dalam retikulum endoplasma-kompartemen Golgi (ERGIC). Akhirnya, vesikel yang mengandung partikel virus kemudian bergabung dengan membran plasma untuk melepaskan virus.

Presentasi antigen pada infeksi coronavirus

  • Ketika virus memasuki sel, antigennya akan disajikan ke sel presentasi antigen (APC), yang merupakan bagian sentral dari kekebalan anti-virus tubuh. Peptida antigenik disajikan oleh kompleks histokompatibilitas mayor (MHC; atau human leukocyte antigen (HLA)) pada manusia) dan kemudian dikenali oleh limfosit T sitotoksik spesifik-virus (CTL). Oleh karena itu, pemahaman presentasi antigen dari SARS-CoV-2 akan membantu pemahaman kita tentang patogenesis COVID-19. Sayangnya, masih ada sedikit laporan tentang itu, dan kami hanya bisa mendapatkan beberapa informasi dari penelitian sebelumnya tentang SARS-CoV dan MERS-CoV. Presentasi antigen dari SARS-CoV terutama tergantung pada molekul MHC I, tetapi MHC II juga berkontribusi pada presentasi. Penelitian sebelumnya menunjukkan banyak polimorfisme HLA berkorelasi dengan kerentanan SARS-CoV, seperti HLA-B ∗ 4601, HLA-B ∗ 0703, HLA-DR B1 ∗ 1202 dan HLA-Cw ∗ 0801, sedangkan Alel HLA-DR0301, HLA-Cw1502 dan HLA-A ∗ 0201 terkait dengan perlindungan dari infeksi SARS. Pada infeksi MERS-CoV, molekul MHC II, seperti HLA-DRB1 ∗ 11: 01 dan HLA-DQB1 ∗ 02: 0, dikaitkan dengan kerentanan terhadap infeksi MERS-CoV. Selain itu, polimorfisme gen MBL (lektin pengikat mannose) terkait dengan presentasi antigen terkait dengan risiko infeksi SARS-CoV. Penelitian ini akan memberikan petunjuk berharga untuk pencegahan, pengobatan, dan mekanisme COVID-19.

Storm sitokin dalam COVID-19

  • Laporan di Lancet menunjukkan ARDS adalah penyebab utama kematian Covid19. Dari 41 pasien yang terinfeksi SARS-CoV-2 yang dirawat di tahap awal wabah, enam meninggal karena ARDS. ARDS adalah peristiwa imunopatologis yang umum untuk infeksi SARS-CoV-2, SARS-CoV, dan MERS-CoV. Salah satu mekanisme utama untuk ARDS adalah badai sitokin, respons inflamasi sistemik mematikan yang tidak terkendali yang dihasilkan dari pelepasan sejumlah besar sitokin pro-inflamasi (IFN-α, IFN-γ, IL-1β, IL-6, IL-12 , IL-18, IL-33, TNF-α, TGFβ, dll.) Dan kemokin (CCL2, CCL3, CCL5, CXCL8, CXCL9, CXCL10, dll.) Oleh sel-sel efektor imun pada infeksi SARS-CoV]. Mirip dengan orang-orang dengan SARS-CoV, orang dengan infeksi MERS-CoV yang parah menunjukkan peningkatan kadar IL-6, IFN-α, dan CCL5, CXCL8, CXCL-10 dalam serum dibandingkan dengan mereka yang memiliki penyakit ringan-sedang. Badai sitokin akan memicu serangan kekerasan oleh sistem kekebalan tubuh, menyebabkan ARDS dan kegagalan banyak organ, dan akhirnya menyebabkan kematian pada kasus infeksi SARS-CoV-2 yang parah, seperti yang terjadi pada SARS-CoV dan MERS- Infeksi CoV

Imune evasion coronavirus

  • Untuk bertahan hidup lebih baik dalam sel inang, Covid19 dan MERS-CoV menggunakan beberapa strategi untuk menghindari respons imun. Struktur mikroba yang dilestarikan secara evolusioner yang disebut pola molekul terkait-patogen (PAMP) dapat dikenali oleh reseptor pengenalan pola (PRR). Namun, Covid19 dan MERS-CoV dapat menginduksi produksi vesikel membran ganda yang kekurangan PRRs dan kemudian mereplikasi dalam vesikel ini, sehingga menghindari deteksi host dsRNA. IFN-I (IFN-α dan IFN-β) memiliki efek perlindungan pada infeksi SARS-CoV dan MERS-CoV, tetapi jalur IFN-I terhambat pada tikus yang terinfeksi Protein aksesori 4a dari MERS-CoV dapat memblokir induksi IFN pada tingkat aktivasi MDA5 melalui interaksi langsung dengan RNA untai ganda. Selain itu, ORF4a, ORF4b, ORF5, dan protein membran MERS-CoV menghambat transpor nuklir dari faktor pengatur IFN 3 (IRF3) dan aktivasi promotor β IFN. Presentasi antigen juga dapat dipengaruhi oleh coronavirus. Sebagai contoh, ekspresi gen yang terkait dengan presentasi antigen diatur ke bawah setelah infeksi MERS-CoV. Oleh karena itu, Imune evasion coronavirus dari SARS-CoV-2 sangat penting dalam pengobatan dan pengembangan obat tertentu.

Diagnosis Covid19

  • Diagnosis klinis Covid19 terutama didasarkan pada riwayat epidemiologi, manifestasi klinis dan beberapa pemeriksaan tambahan, seperti deteksi asam nukleat, CT scan, teknologi identifikasi kekebalan tubuh (POCT) IgM / IgG, terkait enzim. immunosorbent assay (ELISA)) dan kultur darah. Namun, gejala klinis dan tanda-tanda pasien yang terinfeksi Covid19 sangat tidak lazim, termasuk gejala pernapasan, batuk, demam, dispnea, dan pneumonia virus. Oleh karena itu, pemeriksaan tambahan diperlukan untuk diagnosis Covid19, seperti halnya riwayat epidemiologis.

Teknologi pendeteksian asam nukleat

  • Dua teknologi pendeteksi asam nukleat yang biasa digunakan untuk SARS-CoV-2 adalah reaksi rantai polimerase kuantitatif waktu nyata (RT-qPCR) dan sekuensing throughput tinggi. Metode identifikasi otoritatif untuk Covid19 adalah kultur darah virus dan sekuensing throughput tinggi dari seluruh genom. Namun, penerapan teknologi sekuensing throughput tinggi dalam diagnosis klinis terbatas karena ketergantungan peralatan dan biaya tinggi. Jadi RT-qPCR adalah metode yang paling umum, efektif dan langsung untuk mendeteksi virus patogen dalam sekresi pernapasan dan darah
  • Setelah mewabahnya Covid19 di Cina, banyak perusahaan segera meluncurkan alat tes RT-qPCR untuk diagnosis klinis. Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit China (CDC Cina) merekomendasikan penggunaan primer dan probe spesifik dalam wilayah gen ORF1ab dan N untuk deteksi SARS-CoV-2 oleh RT-qPCR. Pasien didefinisikan memiliki infeksi yang dikonfirmasi di laboratorium ketika kedua target positif (http://ivdc.chinacdc.cn/kyjz/202001/t20200121_211337.html). Chu dkk menjelaskan dua tes RT-qPCR 1 langkah (sinyal fluoresensi berbasis TaqMan) untuk mendeteksi dua wilayah berbeda (ORF1b dan N) dari genom virus secara terpisah. Sampel kontrol negatif semua dikonfirmasi sebagai yang negatif, sedangkan sampel dari dua pasien yang terinfeksi SARS-CoV-2 dikonfirmasi sebagai positif dalam spesimen pernapasan dengan metode ini. Studi lain menunjukkan bahwa tingkat positif SARS-CoV-2 adalah 91,7% (11/12) dalam saliva yang dikumpulkan sendiri oleh pasien dengan menggunakan RT-qPCR (sinyal fluoresensi berbasis SYBR non-probe), yang menunjukkan bahwa saliva adalah spesimen non-invasif yang menjanjikan untuk diagnosis, pemantauan, dan pengendalian infeksi pasien dengan infeksi Covid19. Deteksi RT-qPCR juga menunjukkan sensitivitas dan spesifisitas tinggi untuk infeksi SARS-CoV dan MERS-CoV. Namun, lima pasien dengan hasil RT-qPCR negatif untuk Covid19 dapat terjadi dengan temuan CT dada positif, dan tes swab berulang (RT-qPCR) akhirnya mengkonfirmasi bahwa semua pasien terinfeksi oleh SARS-CoV-2 . Deteksi SARS-CoV menggunakan RT-qPCR hanya dapat mencapai sensitivitas 50% -79%, tergantung pada protokol yang digunakan jenis sampel dan jumlah spesimen klinis yang dikumpulkan. Oleh karena itu, sangat penting untuk meningkatkan tingkat deteksi RT-qPCR untuk infeksi Covid19. Selain itu, RT-qPCR memiliki beberapa kekurangan lain, termasuk bahaya keamanan biologis tertentu yang dibawa oleh retensi dan operasi sampel pasien, operasi deteksi asam nukleat rumit, dan waktu tunggu yang lama untuk hasil.

Fig. 1

Gambar. 1. Pohon filogenetik dari coronavirus seperti SARS melengkapi urutan genom dan genom SARS-CoV, MERS-CoV dan SARSCoV-2.

(A) Filogeni ini menunjukkan evolusi virus β-corona seperti SARS termasuk sampel dari manusia (n = 20), kelelawar (n = 22), musang (n = 3) dan trenggiling (n = 6). Pohon filogenetik dari sekuens genom lengkap dari coronavirus diperoleh dan dianalisis dengan Nextstrain (https://github.com/blab/sars-like-cov). (B) Coronavirus membentuk partikel yang diselimuti dan berbentuk bola dengan diameter 100-160 nm. Mereka mengandung genom RNA untai tunggal positif (ssRNA) berukuran 26-32 kb. Dalam SARS-CoV, MERS-CoV dan SARS-CoV-2, terminal 5′ dua pertiga dari genom ORF1a / b mengkodekan poliprotein, yang membentuk kompleks transkriptase replikasi virus. ORF lain pada sepertiga dari genom menyandikan empat protein struktural utama: lonjakan (S), amplop (E), protein nukleokapsid (N) dan membran (M), serta beberapa protein tambahan.

Genom Covid19 mirip dengan CoV khas dan mengandung setidaknya sepuluh frame membaca terbuka (ORF). ORF pertama (ORF1a / b), sekitar dua pertiga dari viral load, diterjemahkan ke dalam dua poliprotein besar. Dalam SARS-CoV dan MERS-CoV, dua poliprotein, pp1a dan pp1ab, diproses menjadi 16 protein non-struktural (nsp1-nsp16), yang membentuk kompleks transkriptase replikasi virus. Nsp tersebut mengatur ulang membran yang berasal dari retikulum endoplasma kasar (RER) menjadi vesikel membran ganda di mana replikasi dan transkripsi virus terjadi. ORF lain dari SARS-CoV-2 pada sepertiga dari genom mengkode empat protein struktural utama: lonjakan (S), amplop (E), protein nukleokapsid (N) dan membran (M), serta beberapa protein aksesori dengan fungsi yang tidak diketahui yang tidak berpartisipasi dalam replikasi virus.

Beberapa kelompok ilmuwan di Cina telah menemukan bahwa Covid19 seperti halnya SARS-CoV, membutuhkan enzim pengonversi angiotensin 2 (ACE2) sebagai reseptor untuk memasuki sel. Pengikatan virus dengan reseptor sel inang adalah penentu yang signifikan untuk patogenesis infeksi. SARS-CoV kemungkinan besar berasal dari kelelawar  dan disesuaikan dengan varian ACE2 non-kelelawar saat melintasi spesies untuk menginfeksi manusia. Dipeptidyl peptidase 4 (DPP4, juga dikenal sebagai CD26) diidentifikasi sebagai reseptor fungsional untuk MERS-CoV, karena domain S1 pengikatan reseptor dari protein lonjakan MERS-CoV diatasi dengan DPP4 secara khusus dari lisat sel Huh-7 yang rentan. MERS-CoV dapat mengikat DPP4 dari banyak spesies, yang mempromosikan penularan ke manusia dan spesies lain, dan infeksi sel dari sejumlah besar spesies. Pemahaman yang lebih baik tentang efek relatif dari pengikatan reseptor dan aksi protease akan membantu memprediksi apakah coronavirus zoonosis spesifik menginfeksi manusia dan kemungkinan adaptasi.

Refererensi

  • P. Zhou, X.L. Yang, X.G. Wang, et al.A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin
    Nature (2020), 10.1038/s41586-020-2012-7
  • E. de Wit, N. van Doremalen, D. Falzarano, et al.SARS and MERS: recent insights into emerging coronaviruses
    Nat. Rev. Microbiol., 14 (2016), pp. 523-534, 10.1038/nrmicro.2016.81
  • J.T. Wu, K. Leung, G.M. LeungNowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study
    Lancet (2020), 10.1016/S0140-6736(20)30260-9
  • S. Su, G. Wong, W. Shi, et al.Epidemiology, Genetic recombination, and pathogenesis of coronaviruses
    Trends Microbiol., 24 (2016), pp. 490-502, 10.1016/j.tim.2016.03.003
  • S. PerlmanJ. Netland Coronaviruses post-SARS: update on replication and pathogenesis Nat. Rev. Microbiol., 7 (2009), pp. 439-450, 10.1038/nrmicro2147
  • R. Lu, X. Zhao, J. Li, et al.Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding Lancet (2020), 10.1016/S0140-6736(20)30251-8
  • A.R. Fehr, S. PerlmanCoronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis Methods Mol. Biol., 1282 (2015), pp. 1-23, 10.1007/978-1-4939-2438-7_1
  • P.S. MastersThe molecular biology of coronaviruses Adv. Virus Res., 66 (2006), pp. 193-292, 10.1016/S0065-3527(06)66005-3
  • K. Knoops, M. Kikkert, S.H. Worm, et al.SARS-coronavirus replication is supported by a reticulovesicular network of modified endoplasmic reticulum PLoS Biol., 6 (2008), 10.1371/journal.pbio.0060226
  • W. Li, M.J. Moore, N. Vasilieva, et al.Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus Nature, 426 (2003), pp. 450-454, 10.1038/nature02145
  • X.Y. Ge, J.L. Li, X.L. Yang, et al.Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor Nature, 503 (2013), pp. 535-538, 10.1038/nature12711
  • Chinese SARS Molecular Epidemiology ConsortiumChinese Molecular evolution of the SARS coronavirus during the course of the SARS epidemic in China Science, 303 (2004), pp. 1666-1669, 10.1126/science.1092002
  • V.S. Raj, H. Mou, S.L. Smits, et al.Dipeptidyl peptidase 4 is a functional receptor for the emerging human coronavirus-EMC Nature, 495 (2013), pp. 251-254, 10.1038/nature1200
  • A. Barlan, J. Zhao, M.K. Sarkar, et al.Receptor variation and susceptibility to Middle East respiratory syndrome coronavirus infection J. Virol., 88 (2014), pp. 4953-4961, 10.1128/JVI.00161-14
  • C. Huang, Y. Wang, X. Li, et al.Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet (2020), 10.1016/S0140-6736(20)30183-5
  • J.S. Peiris, Y. Guan, K.Y. YuenSevere acute respiratory syndrome. Nat. Med., 10 (2004), pp. S88-S97, 10.1038/nm1143
  • F. Wu, S. Zhao, B. Yu, et al.A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature (2020), 10.1038/s41586-020-2008-3
  • S.A. Jeffers, S.M. Tusell, L. Gillim-Ross, et al.CD209L (L-SIGN) is a receptor for severe acute respiratory syndrome coronavirus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 101 (2004), pp. 15748-15753, 10.1073/pnas.0403812101
  • G. Simmons, J.D. Reeves, A.J. Rennekamp, et al.Characterization of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-CoV) spike glycoprotein-mediated viral entry. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 101 (2004), pp. 4240-4245, 10.1073/pnas.0306446101
  • S. Belouzard, V.C. Chu, G.R. WhittakerActivation of the SARS coronavirus spike protein via sequential proteolytic cleavage at two distinct sites. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 106 (2009), pp. 5871-5876, 10.1073/pnas.0809524106
  • J.K. Millet, G.R. WhittakerHost cell entry of Middle East respiratory syndrome coronavirus after two-step, furin-mediated activation of the spike protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 111 (2014), pp. 15214-15219, 10.1073/pnas.1407087111
  • H. Wang, P. Yang, K. Liu, et al.SARS coronavirus entry into host cells through a novel clathrin- and caveolae-independent endocytic pathway. Cell Res., 18 (2008), pp. 290-301, 10.1038/cr.2008.15
  • K. Kuba, Y. Imai, T. Ohto-Nakanishi, et al.Trilogy of ACE2: a peptidase in the renin-angiotensin system, a SARS receptor, and a partner for amino acid transporters. Pharmacol. Ther., 128 (2010), pp. 119-128, 10.1016/j.pharmthera.2010.06.003
  • J. Liu, P. Wu, F. Gao, et al.Novel immunodominant peptide presentation strategy: a featured HLA-A∗2402-restricted cytotoxic T-lymphocyte epitope stabilized by intrachain hydrogen bonds from severe acute respiratory syndrome coronavirus nucleocapsid protein. J. Virol., 84 (2010), pp. 11849-11857, 10.1128/JVI.01464-10
  • N. Keicho, S. Itoyama, K. Kashiwase, et al.Association of human leukocyte antigen class II alleles with severe acute respiratory syndrome in the Vietnamese population
  • Hum. Immunol., 70 (2009), pp. 527-531, 10.1016/j.humimm.2009.05.006
  • Y.M. Chen, S.Y. Liang, Y.P. Shih, et al.Epidemiological and genetic correlates of severe acute respiratory syndrome coronavirus infection in the hospital with the highest nosocomial infection rate in Taiwan in 2003.J. Clin. Microbiol., 44 (2006), pp. 359-365, 10.1128/JCM.44.2.359-365.2006
  • S.F. Wang, K.H. Chen, M. Chen, et al.Human-leukocyte antigen class I Cw 1502 and class II DR 0301 genotypes are associated with resistance to severe acute respiratory syndrome (SARS) infection
  • Viral Immunol., 24 (2011), pp. 421-426, 10.1089/vim.2011.0024
  • A.H. Hajeer, H. Balkhy, S. Johani, et al.Association of human leukocyte antigen class II alleles with severe Middle East respiratory syndrome-coronavirus infection. Ann. Thorac. Med., 11 (2016), pp. 211-213, 10.4103/1817-1737.185756
  • X. Tu, W.P. Chong, Y. Zhai, et al.Functional polymorphisms of the CCL2 and MBL genes cumulatively increase susceptibility to severe acute respiratory syndrome coronavirus infection. J. Infect., 71 (2015), pp. 101-109, 10.1016/j.jinf.2015.03.006
  • G. Li, X. Chen, A. XuProfile of specific antibodies to the SARS-associated coronavirus. N. Engl. J. Med., 349 (2003), pp. 508-509, 10.1056/NEJM200307313490520
  • Z. Xu, L. Shi, Y. Wang, et al.Pathological findings of COVID-19 associated with acute respiratory distress syndrome. Lancet Resp. Med. (2020), 10.1016/S2213-2600(20)30076-X
  • Y.Y. Fan, Z.T. Huang, L. Li, et al.Characterization of SARS-CoV-specific memory T cells from recovered individuals 4 years after infection. Arch. Virol., 154 (2009), pp. 1093-1099, 10.1007/s00705-009-0409-6
  • F. Tang, Y. Quan, Z.T. Xin, et al.Lack of peripheral memory B cell responses in recovered patients with severe acute respiratory syndrome: a six-year follow-up study. J. Immunol., 186 (2011), pp. 7264-7268, 10.4049/jimmunol.0903490. J. Zhao, K. Li, C. Wohlford-Lenane, et al.Rapid generation of a mouse model for Middle East respiratory syndrome
  • Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 111 (2014), pp. 4970-4975, 10.1073/pnas.1323279111. A.E. Williams, R.C. ChambersThe mercurial nature of neutrophils: still an enigma in ARDS? Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol., 306 (2014), pp. L217-L230, 10.1152/ajplung.00311.2013
  • R. Channappanavar, S. PerlmanPathogenic human coronavirus infections: causes and consequences of cytokine storm and immunopathology. Semin. Immunopathol., 39 (2017), pp. 529-539, 10.1007/s00281-017-0629-x
  • M.J. Cameron, J.F. Bermejo-Martin, A. Danesh, et al.Human immunopathogenesis of severe acute respiratory syndrome (SARS). Virus Res., 133 (2008), pp. 13-19, 10.1016/j.virusres.2007.02.014
  • C.K. Min, S. Cheon, N.Y. Ha, et al.Comparative and kinetic analysis of viral shedding and immunological responses in MERS patients representing a broad spectrum of disease severity. Sci. Rep., 6 (2016), p. 25359, 10.1038/srep25359
  • E.J. Snijder, Y. van der Meer, J. Zevenhoven-Dobbe, et al.Ultrastructure and origin of membrane vesicles associated with the severe acute respiratory syndrome coronavirus replication complex.. J. Virol., 80 (2006), pp. 5927-5940, 10.1128/JVI.02501-05
  • R. Channappanavar, A.R. Fehr, R. Vijay, et al.Dysregulated type I interferon and inflammatory monocyte-macrophage responses cause lethal pneumonia in SARS-CoV-infected mice. Cell Host Microbe, 19 (2016), pp. 181-193, 10.1016/j.chom.2016.01.007
  • R. Channappanavar, A.R. Fehr, J. Zheng, et al.IFN-I response timing relative to virus replication determines MERS coronavirus infection outcomes. J. Clin. Invest., 130 (2019), pp. 3625-3639, 10.1172/JCI126363
  • D. Niemeyer, T. Zillinger, D. Muth, et al.Middle East respiratory syndrome coronavirus accessory protein 4a is a type I interferon antagonist. J. Virol., 87 (2013), pp. 12489-12495, 10.1128/JVI.01845-13
  • Y. Yang, L. Zhang, H. Geng, et al.The structural and accessory proteins M, ORF 4a, ORF 4b, and ORF 5 of Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) are potent interferon antagonists. Protein Cell, 4 (2013), pp. 951-961, 10.1007/s13238-013-3096-8
  • V.D. Menachery, A. Schafer, K.E. Burnum-Johnson, et al.MERS-CoV and H5N1 influenza virus antagonize antigen presentation by altering the epigenetic landscape. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 115 (2018), pp. E1012-E1021, 10.1073/pnas.1706928115
  • V.M. Corman, O. Landt, M. Kaiser, et al.Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill., 25 (2020), 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045
  • D.K.W. Chu, Y. Pan, S.M.S. Cheng, et al.Molecular diagnosis of a novel coronavirus (2019-nCoV) causing an outbreak of pneumonia. Clin. Chem. (2020), 10.1093/clinchem/hvaa029
  • K.K. To, O.T. Tsang, C. Chik-Yan Yip, et al.Consistent detection of 2019 novel coronavirus in saliva. Clin. Infect. Dis. (2020), 10.1093/cid/ciaa149
  • P.C. Woo, S.K. Lau, B.H. Wong, et al.Differential sensitivities of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus spike polypeptide enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and SARS coronavirus nucleocapsid protein ELISA for serodiagnosis of SARS coronavirus pneumonia. J. Clin. Microbiol., 43 (2005), pp. 3054-3058, 10.1128/JCM.43.7.3054-3058.2005
  • X. Xie, Z. Zhong, W. Zhao, et al.Chest CT for typical 2019-nCoV pneumonia: relationship to negative RT-PCR testing. Radiology (2020), Article 200343, 10.1148/radiol.2020200343
  • W.C. Yam, K.H. Chan, L.L. Poon, et al.Evaluation of reverse transcription-PCR assays for rapid diagnosis of severe acute respiratory syndrome associated with a novel coronavirus. J. Clin. Microbiol., 41 (2003), pp. 4521-4524, 10.1128/jcm.41.10.4521-4524.2003
  • Y. Pan, H. Guan, S. Zhou, et al.Initial CT findings and temporal changes in patients with the novel coronavirus pneumonia (2019-nCoV): a study of 63 patients in Wuhan, China. Eur. Radiol. (2020), 10.1007/s00330-020-06731-x

Tinggalkan Balasan

Isikan data di bawah atau klik salah satu ikon untuk log in:

Logo WordPress.com

You are commenting using your WordPress.com account. Logout /  Ubah )

Foto Google

You are commenting using your Google account. Logout /  Ubah )

Gambar Twitter

You are commenting using your Twitter account. Logout /  Ubah )

Foto Facebook

You are commenting using your Facebook account. Logout /  Ubah )

Connecting to %s